首届世锦赛于2000年1月在巴西举行，国际足协希望赛事能够改变洲际杯（丰田杯）原本只由欧洲及南美洲球会参加之型态，在这项新赛事能够吸纳全球六大洲最顶级的球会参与，可惜国际足协未能与洲际杯主办机构达成协议，因此洲际杯及世锦赛得以同于2000年举行。
首届世锦赛并不受到外界欢迎，2001年第二届赛事原本订于西班牙举行，参赛球队增至12队，但其后国际足协市场推广公司ISL突然倒闭，最终赛事因而取消。2003年打算复办赛事，但仍然无法举行。最终国际足协与洲际杯达成协议，将两项赛事合二为一，重新开办的国际足协世界冠军球会杯正式于2005年在日本举行。
2005年至2008年，每一届赛事都在日本举行。2009年起，世冠杯改为轮流在其他国家上演，每个国家各办2届，但之后必须回归日本主办2届（2011及12年，2015及16年，如此类推）。
2017年，国际足联正式承认所有赢得洲际杯（1960 年至 2004 年期间举行）的欧洲和南美球队为俱乐部世界冠军。[3][4]
2022年12月17日，国际足联宣布2025年6月举行的世俱杯改制为32支球队参加，此后每四年举办一次。[5]而原有赛制则以国际足协洲际杯名义继续举办，并改在举行世冠杯以外的年份进行。